Trang chủ / Cơ sở khoa học

Cơ sở khoa học

Dự án nền tảng

Dự án Giải trình tự 1000 hệ gen người Việt

  • Tập mẫu: 1.008 mẫu
  • Độ sâu giải trình tự: 30x

Tổng quan

Việt Nam là nước đông dân thứ 15 trên thế giới. Tuy nhiên, các nghiên cứu di truyền cho người Việt chủ yếu dựa trên các... Xem thêm

Đối tác chiến lược

Hệ thống quản lý, phân tích và chia sẻ dữ liệu y sinh

  • Dữ liệu: 3.500+ TB
  • CPU: 1.000+ core
  • RAM: 8.000+ GB

Tổng quan

Các dự án dữ liệu lớn hiện nay (lên đến cỡ petabyte hay thậm chí exabyte) trong nhiều lĩnh vực chẳng hạn như y sinh học... Xem thêm

Đối tác chiến lược

Xây dựng hệ gen tham chiếu của người Việt

  • Nucleotide: 3+ Tỷ
  • Biến thể gen: 2+ Triệu
  • Giải trình tự: 5+ Công nghệ

Tổng quan

Hệ gen tham chiếu trên thế giới được xây dựng gần đây nhất (hg37/38) dựa trên quần thể người Mỹ và Châu Âu. Hiện tại, phân... Xem thêm

Đối tác chiến lược

Dự đoán nguy cơ bệnh cho người Việt

  • Tiểu đường loại 2: 1.500+ Mẫu
  • Bệnh thông thường khác: 600+ Mẫu

Tổng quan

Bệnh di truyền gây ra bởi đột biến trong gen hoặc những thay đổi bất thường của nhiễm sắc thể. Các bệnh này có khả năng... Xem thêm

Đối tác chiến lược

Nghiên cứu sàng lọc gen liên quan đến tác dụng phụ của thuốc

  • SCAR: 300+ Mẫu
  • NSAID Hypersensitivity: 300+ Mẫu
  • DILI: 500+ Mẫu
  • Sàng lọc HLA: 2.000+ Mẫu

Tổng quan

Theo công trình nghiên cứu kéo dài 20 năm của TS. Collin Campbell và đồng nghiệp tại khoa Y của Đại học Rochester, nguyên nhân dẫn... Xem thêm

Đối tác chiến lược

Hạ tầng dữ liệu

CƠ SỞ DỮ LIỆU

0 + TB
Dữ liệu gen người Việt

WGS, WES, RNA-Seq, Genotyping, Single-cell Sequencing, HLA typing

0 +
Biến thể gen trên người Việt

Trong đó có 2 triệu biến thể phổ biến mới trên người Việt

0 +
Mẫu tham chiếu người Việt khoẻ

CSDL toàn diện nhất về biến thể gen người Việt tính đến 2022

WGS,WES, RNA-Seq, Single-cell Sequencing

0 +
Mẫu bệnh phổ biến trên người Việt

Tiểu đường, tim mạch, ung thư và 10 loại bệnh phổ biến khác

WGS, WES, RNA-Seq, Genotyping, Single-cell Sequencing, HLA typing

0 +
Mẫu tác dụng phụ của thuốc trên người Việt

SCAR, NSAID hypersensitivity, DILIWGS, WES, RNA-Seq, Genotyping, Single-cell Sequencing, HLA typing

0 +
Mẫu các tính trạng phổ biến trên người Việt

Sức khoẻ làn da, dinh dưỡng, thể chất lối sống, sức khoẻ tinh thần

Genotyping, WGS

CƠ SỞ HẠ TẦNG

Quy trình phân tích chuẩn Quốc tế

Kiểm soát chất lượng dữ liệu nghiêm ngặt

  • Chính xác >99.999%, tương ứng chất lượng từng base trên Q30

Phân tích dữ liệu với các phần mềm tiên tiến

  • Dragen chạy trên card FPGA từ Illumina
  • GATK từ Broad Institute of MIT and Harvard
  • DeepVariant từ Google được tối ưu hoá trên nền tảng Parabricks từ Nvidia

Kiểm định kết quả với nhiều công nghệ đối sánh

  • Đồng thuận trên 99.9% với kết quả genotyping từ Illumina và Affymetrix

Hệ thống phần mềm chuẩn Quốc tế

Quy trình phát triển phần mềm tiên tiến ứng dụng Agile/SCRUM

An toàn bảo mật thông tin theo chuẩn quốc tế: OWASP, NIST, SANS

Kiến trúc Microservice áp dụng nguyên lý Domain Driven Design

Công nghệ BigData: Spark, Hadoop, Elasticsearch, Kafka, Object Storage

Công bố khoa học

2020 Jan 2

PLANTS (BASEL), 2020

Complete Chloroplast Genome of Paphiopedilum delenatii and Phylogenetic Relationships among Orchidaceae

Vu HT, Tran N, Nguyen TD, Vu QL, Bui MH, Le MT, Le L.

2019 Dec 24

JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, 2020

Plant Metabolite Databases: From Herbal Medicines to Modern Drug Discovery

Nguyen-Vo, Thanh-Hoang; Nguyen, Loc; Do, Nguyet; Nguyen, Thien-Ngan; Trinh, Khang; Cao, Hung; Le Ly

Bạn đã sẵn sàng khởi đầu hành trình sức khỏe từ gen cùng GeneStory?

This site is registered on wpml.org as a development site. Switch to a production site key to remove this banner.